Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
VIL1P09327 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
VIL1P09327 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
VIL1P09327 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
VIL1P09327 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
VIL1P09327 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
VIL1P09327 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
VIL1P09327 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
VIL1P09327 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
VIL1P09327 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
VIL1P09327 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
VIL1P09327 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
VIL1P09327 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
VIL1P09327 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
VIL1P09327 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
VIL1P09327 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
VIL1P09327 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
VIL1P09327 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
VIL1P09327 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
VIL1P09327 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
VIL1P09327 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
VIL1P09327 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
VIL1P09327 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
VIL1P09327 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
VIL1P09327 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
VIL1P09327 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
VIL1P09327 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
VIL1P09327 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
VIL1P09327 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
VIL1P09327 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
VIL1P09327 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
VIL1P09327 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
VIL1P09327 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
VIL1P09327 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
VIL1P09327 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
VIL1P09327 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
VIL1P09327 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
VIL1P09327 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VIL1P09327 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
VIL1P09327 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
VIL1P09327 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VIL1P09327 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
VIL1P09327 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VIL1P09327 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
VIL1P09327 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
VIL1P09327 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
VIL1P09327 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VIL1P09327 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
VIL1P09327 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VIL1P09327 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VIL1P09327 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VIL1P09327 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VIL1P09327 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VIL1P09327 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VIL1P09327 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VIL1P09327 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
VIL1P09327 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
VIL1P09327 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
VIL1P09327 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
VIL1P09327 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
VIL1P09327 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
VIL1P09327 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VIL1P09327 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
VIL1P09327 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
VIL1P09327 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VIL1P09327 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VIL1P09327 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VIL1P09327 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
VIL1P09327 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
VIL1P09327 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
VIL1P09327 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
VIL1P09327 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
VIL1P09327 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
VIL1P09327 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
VIL1P09327 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
VIL1P09327 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
VIL1P09327 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
VIL1P09327 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
VIL1P09327 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
VIL1P09327 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
VIL1P09327 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
VIL1P09327 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
VIL1P09327 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
VIL1P09327 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VIL1P09327 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
VIL1P09327 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
VIL1P09327 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
VIL1P09327 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
VIL1P09327 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
VIL1P09327 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
VIL1P09327 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
VIL1P09327 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
VIL1P09327 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
VIL1P09327 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
VIL1P09327 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
VIL1P09327 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VIL1P09327 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VIL1P09327 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
VIL1P09327 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VIL1P09327 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms