Protein–RNA interactions for Protein: P08708

RPS17, 40S ribosomal protein S17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS17P08708 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS17P08708 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS17P08708 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS17P08708 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS17P08708 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS17P08708 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS17P08708 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS17P08708 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS17P08708 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS17P08708 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS17P08708 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS17P08708 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS17P08708 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS17P08708 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS17P08708 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS17P08708 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS17P08708 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS17P08708 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS17P08708 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS17P08708 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS17P08708 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS17P08708 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS17P08708 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS17P08708 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS17P08708 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS17P08708 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS17P08708 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS17P08708 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS17P08708 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS17P08708 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS17P08708 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS17P08708 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS17P08708 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS17P08708 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS17P08708 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS17P08708 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS17P08708 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS17P08708 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS17P08708 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS17P08708 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS17P08708 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS17P08708 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS17P08708 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS17P08708 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS17P08708 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS17P08708 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS17P08708 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS17P08708 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS17P08708 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS17P08708 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS17P08708 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS17P08708 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS17P08708 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS17P08708 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS17P08708 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS17P08708 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS17P08708 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPS17P08708 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS17P08708 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS17P08708 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS17P08708 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS17P08708 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS17P08708 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS17P08708 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS17P08708 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS17P08708 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS17P08708 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS17P08708 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS17P08708 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS17P08708 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS17P08708 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS17P08708 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS17P08708 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS17P08708 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS17P08708 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS17P08708 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS17P08708 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS17P08708 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS17P08708 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS17P08708 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS17P08708 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS17P08708 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS17P08708 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS17P08708 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS17P08708 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS17P08708 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS17P08708 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS17P08708 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS17P08708 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS17P08708 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS17P08708 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS17P08708 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS17P08708 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS17P08708 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPS17P08708 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPS17P08708 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPS17P08708 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS17P08708 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS17P08708 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS17P08708 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.2 ms