Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNC2P02585 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNC2P02585 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNC2P02585 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNC2P02585 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNC2P02585 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNC2P02585 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNC2P02585 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNC2P02585 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNC2P02585 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNC2P02585 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNC2P02585 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNC2P02585 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNC2P02585 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNC2P02585 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNC2P02585 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNC2P02585 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNC2P02585 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNC2P02585 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNC2P02585 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNC2P02585 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNC2P02585 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNC2P02585 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNC2P02585 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNC2P02585 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNC2P02585 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNC2P02585 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNC2P02585 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNC2P02585 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNC2P02585 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNC2P02585 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNC2P02585 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNC2P02585 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNC2P02585 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNC2P02585 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNC2P02585 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNC2P02585 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNC2P02585 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNNC2P02585 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNNC2P02585 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNC2P02585 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNC2P02585 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNC2P02585 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNC2P02585 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNC2P02585 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNC2P02585 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNC2P02585 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNC2P02585 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNC2P02585 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNC2P02585 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNC2P02585 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNC2P02585 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNC2P02585 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNC2P02585 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNC2P02585 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNC2P02585 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNC2P02585 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNC2P02585 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNC2P02585 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNC2P02585 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNC2P02585 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNC2P02585 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNC2P02585 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNC2P02585 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNNC2P02585 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNC2P02585 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNC2P02585 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNC2P02585 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNC2P02585 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNC2P02585 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNC2P02585 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNC2P02585 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNC2P02585 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNC2P02585 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNC2P02585 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNC2P02585 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNC2P02585 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNC2P02585 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNC2P02585 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNC2P02585 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNC2P02585 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNC2P02585 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNC2P02585 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNC2P02585 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNC2P02585 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNC2P02585 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNC2P02585 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNC2P02585 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNC2P02585 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNC2P02585 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNC2P02585 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNC2P02585 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNC2P02585 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
TNNC2P02585 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TNNC2P02585 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNNC2P02585 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TNNC2P02585 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNNC2P02585 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNNC2P02585 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNNC2P02585 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms