Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED1O96006 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED1O96006 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED1O96006 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED1O96006 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED1O96006 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED1O96006 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED1O96006 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED1O96006 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED1O96006 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED1O96006 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED1O96006 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED1O96006 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED1O96006 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED1O96006 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED1O96006 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED1O96006 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ZBED1O96006 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED1O96006 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED1O96006 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED1O96006 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED1O96006 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED1O96006 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED1O96006 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED1O96006 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED1O96006 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED1O96006 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED1O96006 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED1O96006 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED1O96006 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZBED1O96006 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZBED1O96006 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED1O96006 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED1O96006 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED1O96006 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED1O96006 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED1O96006 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED1O96006 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED1O96006 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED1O96006 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED1O96006 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED1O96006 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED1O96006 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED1O96006 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED1O96006 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED1O96006 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED1O96006 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED1O96006 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED1O96006 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED1O96006 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ZBED1O96006 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED1O96006 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED1O96006 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED1O96006 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED1O96006 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED1O96006 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED1O96006 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED1O96006 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED1O96006 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED1O96006 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED1O96006 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED1O96006 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED1O96006 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED1O96006 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED1O96006 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED1O96006 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED1O96006 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED1O96006 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED1O96006 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED1O96006 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED1O96006 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZBED1O96006 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZBED1O96006 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZBED1O96006 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZBED1O96006 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZBED1O96006 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZBED1O96006 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZBED1O96006 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED1O96006 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED1O96006 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED1O96006 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED1O96006 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED1O96006 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED1O96006 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED1O96006 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
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