Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24DO94855 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC24DO94855 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC24DO94855 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC24DO94855 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24DO94855 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24DO94855 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24DO94855 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24DO94855 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24DO94855 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24DO94855 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24DO94855 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24DO94855 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24DO94855 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24DO94855 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24DO94855 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24DO94855 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24DO94855 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24DO94855 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24DO94855 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24DO94855 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24DO94855 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24DO94855 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24DO94855 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24DO94855 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24DO94855 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24DO94855 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24DO94855 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24DO94855 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24DO94855 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC24DO94855 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC24DO94855 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC24DO94855 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms