Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCTN3O75935 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCTN3O75935 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCTN3O75935 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCTN3O75935 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCTN3O75935 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCTN3O75935 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCTN3O75935 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCTN3O75935 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCTN3O75935 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCTN3O75935 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCTN3O75935 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCTN3O75935 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCTN3O75935 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCTN3O75935 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCTN3O75935 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCTN3O75935 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCTN3O75935 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCTN3O75935 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCTN3O75935 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCTN3O75935 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCTN3O75935 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCTN3O75935 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCTN3O75935 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCTN3O75935 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCTN3O75935 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCTN3O75935 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DCTN3O75935 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DCTN3O75935 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCTN3O75935 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCTN3O75935 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCTN3O75935 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCTN3O75935 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCTN3O75935 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCTN3O75935 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCTN3O75935 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCTN3O75935 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCTN3O75935 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCTN3O75935 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCTN3O75935 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCTN3O75935 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCTN3O75935 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DCTN3O75935 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCTN3O75935 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCTN3O75935 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCTN3O75935 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCTN3O75935 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCTN3O75935 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCTN3O75935 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DCTN3O75935 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCTN3O75935 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms