Protein–RNA interactions for Protein: O75208

COQ9, Ubiquinone biosynthesis protein COQ9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ9O75208 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COQ9O75208 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COQ9O75208 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COQ9O75208 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COQ9O75208 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COQ9O75208 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COQ9O75208 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COQ9O75208 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COQ9O75208 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COQ9O75208 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COQ9O75208 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COQ9O75208 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
COQ9O75208 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
COQ9O75208 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COQ9O75208 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COQ9O75208 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COQ9O75208 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COQ9O75208 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COQ9O75208 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COQ9O75208 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COQ9O75208 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COQ9O75208 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COQ9O75208 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COQ9O75208 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COQ9O75208 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COQ9O75208 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COQ9O75208 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COQ9O75208 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COQ9O75208 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COQ9O75208 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COQ9O75208 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COQ9O75208 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COQ9O75208 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COQ9O75208 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COQ9O75208 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COQ9O75208 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COQ9O75208 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COQ9O75208 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COQ9O75208 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COQ9O75208 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COQ9O75208 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COQ9O75208 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COQ9O75208 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COQ9O75208 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COQ9O75208 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COQ9O75208 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COQ9O75208 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COQ9O75208 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COQ9O75208 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COQ9O75208 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COQ9O75208 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COQ9O75208 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COQ9O75208 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COQ9O75208 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COQ9O75208 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COQ9O75208 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
COQ9O75208 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COQ9O75208 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COQ9O75208 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COQ9O75208 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COQ9O75208 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COQ9O75208 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COQ9O75208 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COQ9O75208 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COQ9O75208 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COQ9O75208 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COQ9O75208 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COQ9O75208 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COQ9O75208 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COQ9O75208 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COQ9O75208 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COQ9O75208 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COQ9O75208 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COQ9O75208 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COQ9O75208 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COQ9O75208 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COQ9O75208 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COQ9O75208 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COQ9O75208 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COQ9O75208 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COQ9O75208 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COQ9O75208 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COQ9O75208 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COQ9O75208 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COQ9O75208 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COQ9O75208 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COQ9O75208 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COQ9O75208 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COQ9O75208 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COQ9O75208 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COQ9O75208 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COQ9O75208 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COQ9O75208 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COQ9O75208 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COQ9O75208 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COQ9O75208 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COQ9O75208 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COQ9O75208 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COQ9O75208 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COQ9O75208 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.5 ms