Protein–RNA interactions for Protein: O75140

DEPDC5, GATOR complex protein DEPDC5, humanhuman

Predictions only

Length 1,603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC5O75140 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
DEPDC5O75140 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
DEPDC5O75140 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
DEPDC5O75140 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
DEPDC5O75140 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
DEPDC5O75140 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
DEPDC5O75140 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
DEPDC5O75140 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
DEPDC5O75140 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
DEPDC5O75140 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
DEPDC5O75140 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
DEPDC5O75140 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
DEPDC5O75140 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
DEPDC5O75140 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
DEPDC5O75140 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.5
DEPDC5O75140 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
DEPDC5O75140 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
DEPDC5O75140 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
DEPDC5O75140 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
DEPDC5O75140 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
DEPDC5O75140 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
DEPDC5O75140 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
DEPDC5O75140 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
DEPDC5O75140 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
DEPDC5O75140 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
DEPDC5O75140 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
DEPDC5O75140 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
DEPDC5O75140 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
DEPDC5O75140 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
DEPDC5O75140 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
DEPDC5O75140 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
DEPDC5O75140 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
DEPDC5O75140 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
DEPDC5O75140 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
DEPDC5O75140 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
DEPDC5O75140 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
DEPDC5O75140 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
DEPDC5O75140 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
DEPDC5O75140 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
DEPDC5O75140 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
DEPDC5O75140 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
DEPDC5O75140 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
DEPDC5O75140 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
DEPDC5O75140 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
DEPDC5O75140 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
DEPDC5O75140 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
DEPDC5O75140 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
DEPDC5O75140 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
DEPDC5O75140 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
DEPDC5O75140 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
DEPDC5O75140 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
DEPDC5O75140 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
DEPDC5O75140 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
DEPDC5O75140 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
DEPDC5O75140 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
DEPDC5O75140 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
DEPDC5O75140 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
DEPDC5O75140 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
DEPDC5O75140 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
DEPDC5O75140 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
DEPDC5O75140 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
DEPDC5O75140 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
DEPDC5O75140 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
DEPDC5O75140 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
DEPDC5O75140 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
DEPDC5O75140 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
DEPDC5O75140 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
DEPDC5O75140 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
DEPDC5O75140 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
DEPDC5O75140 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
DEPDC5O75140 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
DEPDC5O75140 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
DEPDC5O75140 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
DEPDC5O75140 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
DEPDC5O75140 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
DEPDC5O75140 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
DEPDC5O75140 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
DEPDC5O75140 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
DEPDC5O75140 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
DEPDC5O75140 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
DEPDC5O75140 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
DEPDC5O75140 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
DEPDC5O75140 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
DEPDC5O75140 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
DEPDC5O75140 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
DEPDC5O75140 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
DEPDC5O75140 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
DEPDC5O75140 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
DEPDC5O75140 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
DEPDC5O75140 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
DEPDC5O75140 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
DEPDC5O75140 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
DEPDC5O75140 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
DEPDC5O75140 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
DEPDC5O75140 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
DEPDC5O75140 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
DEPDC5O75140 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
DEPDC5O75140 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
DEPDC5O75140 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
DEPDC5O75140 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms