Protein–RNA interactions for Protein: O75096

LRP4, Low-density lipoprotein receptor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP4O75096 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRP4O75096 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRP4O75096 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRP4O75096 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRP4O75096 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRP4O75096 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRP4O75096 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRP4O75096 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRP4O75096 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRP4O75096 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRP4O75096 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRP4O75096 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRP4O75096 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRP4O75096 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRP4O75096 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRP4O75096 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRP4O75096 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LRP4O75096 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRP4O75096 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRP4O75096 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRP4O75096 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRP4O75096 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRP4O75096 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRP4O75096 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRP4O75096 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRP4O75096 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRP4O75096 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRP4O75096 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRP4O75096 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRP4O75096 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRP4O75096 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRP4O75096 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRP4O75096 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRP4O75096 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LRP4O75096 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRP4O75096 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRP4O75096 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LRP4O75096 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRP4O75096 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRP4O75096 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRP4O75096 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRP4O75096 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRP4O75096 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRP4O75096 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRP4O75096 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRP4O75096 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRP4O75096 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRP4O75096 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRP4O75096 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRP4O75096 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRP4O75096 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRP4O75096 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRP4O75096 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRP4O75096 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRP4O75096 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRP4O75096 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRP4O75096 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRP4O75096 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRP4O75096 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP4O75096 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP4O75096 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP4O75096 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP4O75096 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP4O75096 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP4O75096 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP4O75096 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP4O75096 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP4O75096 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP4O75096 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP4O75096 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP4O75096 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP4O75096 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRP4O75096 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRP4O75096 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRP4O75096 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRP4O75096 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRP4O75096 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRP4O75096 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRP4O75096 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRP4O75096 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRP4O75096 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRP4O75096 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRP4O75096 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRP4O75096 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP4O75096 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP4O75096 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP4O75096 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP4O75096 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP4O75096 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP4O75096 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP4O75096 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP4O75096 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP4O75096 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP4O75096 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRP4O75096 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRP4O75096 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRP4O75096 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRP4O75096 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRP4O75096 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRP4O75096 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms