Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
BRD4O60885 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
BRD4O60885 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
BRD4O60885 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
BRD4O60885 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
BRD4O60885 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
BRD4O60885 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
BRD4O60885 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
BRD4O60885 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
BRD4O60885 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
BRD4O60885 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
BRD4O60885 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
BRD4O60885 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
BRD4O60885 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
BRD4O60885 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
BRD4O60885 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
BRD4O60885 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
BRD4O60885 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
BRD4O60885 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
BRD4O60885 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
BRD4O60885 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
BRD4O60885 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.48■■■■□ 3.11
BRD4O60885 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
BRD4O60885 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
BRD4O60885 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
BRD4O60885 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
BRD4O60885 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
BRD4O60885 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
BRD4O60885 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
BRD4O60885 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
BRD4O60885 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
BRD4O60885 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
BRD4O60885 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
BRD4O60885 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
BRD4O60885 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
BRD4O60885 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
BRD4O60885 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.43■■■■□ 3.1
BRD4O60885 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
BRD4O60885 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
BRD4O60885 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
BRD4O60885 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
BRD4O60885 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
BRD4O60885 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BRD4O60885 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BRD4O60885 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
BRD4O60885 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BRD4O60885 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BRD4O60885 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BRD4O60885 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BRD4O60885 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
BRD4O60885 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
BRD4O60885 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
BRD4O60885 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
BRD4O60885 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
BRD4O60885 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
BRD4O60885 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BRD4O60885 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BRD4O60885 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BRD4O60885 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BRD4O60885 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BRD4O60885 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BRD4O60885 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BRD4O60885 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
BRD4O60885 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
BRD4O60885 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
BRD4O60885 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
BRD4O60885 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
BRD4O60885 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
BRD4O60885 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
BRD4O60885 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
BRD4O60885 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
BRD4O60885 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
BRD4O60885 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
BRD4O60885 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
BRD4O60885 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
BRD4O60885 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
BRD4O60885 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
BRD4O60885 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
BRD4O60885 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
BRD4O60885 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
BRD4O60885 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
BRD4O60885 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
BRD4O60885 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
BRD4O60885 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
BRD4O60885 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
BRD4O60885 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
BRD4O60885 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
BRD4O60885 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
BRD4O60885 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
BRD4O60885 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
BRD4O60885 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
BRD4O60885 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
BRD4O60885 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
BRD4O60885 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
BRD4O60885 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
BRD4O60885 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
BRD4O60885 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
BRD4O60885 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
BRD4O60885 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
BRD4O60885 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms