Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIC3O60481 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIC3O60481 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIC3O60481 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIC3O60481 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZIC3O60481 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZIC3O60481 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZIC3O60481 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZIC3O60481 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZIC3O60481 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZIC3O60481 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZIC3O60481 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIC3O60481 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIC3O60481 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIC3O60481 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIC3O60481 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZIC3O60481 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZIC3O60481 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZIC3O60481 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZIC3O60481 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZIC3O60481 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZIC3O60481 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZIC3O60481 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZIC3O60481 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIC3O60481 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZIC3O60481 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZIC3O60481 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZIC3O60481 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZIC3O60481 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZIC3O60481 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZIC3O60481 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZIC3O60481 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZIC3O60481 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZIC3O60481 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZIC3O60481 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZIC3O60481 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIC3O60481 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIC3O60481 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIC3O60481 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIC3O60481 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIC3O60481 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIC3O60481 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIC3O60481 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIC3O60481 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIC3O60481 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIC3O60481 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIC3O60481 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIC3O60481 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZIC3O60481 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZIC3O60481 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIC3O60481 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms