Protein–RNA interactions for Protein: O60383

GDF9, Growth/differentiation factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF9O60383 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF9O60383 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF9O60383 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF9O60383 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDF9O60383 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDF9O60383 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDF9O60383 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDF9O60383 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDF9O60383 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDF9O60383 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDF9O60383 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF9O60383 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF9O60383 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF9O60383 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF9O60383 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF9O60383 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF9O60383 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF9O60383 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF9O60383 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF9O60383 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF9O60383 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF9O60383 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF9O60383 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF9O60383 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF9O60383 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF9O60383 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF9O60383 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF9O60383 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF9O60383 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF9O60383 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF9O60383 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF9O60383 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF9O60383 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF9O60383 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF9O60383 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF9O60383 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF9O60383 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF9O60383 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF9O60383 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF9O60383 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF9O60383 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF9O60383 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF9O60383 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF9O60383 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF9O60383 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF9O60383 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF9O60383 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF9O60383 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF9O60383 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF9O60383 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF9O60383 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF9O60383 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF9O60383 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF9O60383 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF9O60383 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF9O60383 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF9O60383 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF9O60383 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDF9O60383 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF9O60383 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF9O60383 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF9O60383 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF9O60383 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF9O60383 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF9O60383 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF9O60383 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF9O60383 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF9O60383 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF9O60383 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF9O60383 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF9O60383 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF9O60383 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF9O60383 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF9O60383 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF9O60383 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF9O60383 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF9O60383 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF9O60383 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF9O60383 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF9O60383 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF9O60383 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF9O60383 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF9O60383 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF9O60383 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF9O60383 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF9O60383 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF9O60383 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF9O60383 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF9O60383 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF9O60383 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GDF9O60383 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GDF9O60383 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF9O60383 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF9O60383 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF9O60383 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF9O60383 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF9O60383 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF9O60383 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF9O60383 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF9O60383 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms