Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD5O60279 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUSD5O60279 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD5O60279 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD5O60279 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms