Protein–RNA interactions for Protein: O60224

SSX4, Protein SSX4, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX4O60224 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX4O60224 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX4O60224 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX4O60224 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX4O60224 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX4O60224 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX4O60224 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX4O60224 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX4O60224 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX4O60224 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX4O60224 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX4O60224 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX4O60224 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX4O60224 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX4O60224 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX4O60224 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX4O60224 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX4O60224 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX4O60224 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX4O60224 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX4O60224 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX4O60224 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX4O60224 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX4O60224 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX4O60224 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX4O60224 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX4O60224 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX4O60224 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX4O60224 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX4O60224 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX4O60224 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX4O60224 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX4O60224 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX4O60224 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX4O60224 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX4O60224 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX4O60224 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX4O60224 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX4O60224 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX4O60224 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX4O60224 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX4O60224 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX4O60224 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX4O60224 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX4O60224 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX4O60224 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX4O60224 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSX4O60224 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSX4O60224 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSX4O60224 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSX4O60224 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSX4O60224 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSX4O60224 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSX4O60224 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSX4O60224 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSX4O60224 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX4O60224 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX4O60224 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX4O60224 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX4O60224 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX4O60224 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX4O60224 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX4O60224 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX4O60224 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX4O60224 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX4O60224 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX4O60224 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX4O60224 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX4O60224 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX4O60224 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX4O60224 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX4O60224 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX4O60224 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX4O60224 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX4O60224 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX4O60224 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX4O60224 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX4O60224 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX4O60224 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX4O60224 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX4O60224 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX4O60224 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX4O60224 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX4O60224 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX4O60224 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX4O60224 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX4O60224 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX4O60224 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX4O60224 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX4O60224 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX4O60224 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX4O60224 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX4O60224 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX4O60224 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SSX4O60224 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX4O60224 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX4O60224 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX4O60224 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX4O60224 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX4O60224 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms