Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR2O43760 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYNGR2O43760 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYNGR2O43760 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNGR2O43760 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNGR2O43760 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNGR2O43760 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNGR2O43760 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNGR2O43760 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNGR2O43760 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNGR2O43760 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNGR2O43760 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNGR2O43760 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNGR2O43760 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNGR2O43760 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR2O43760 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR2O43760 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR2O43760 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR2O43760 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR2O43760 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR2O43760 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR2O43760 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR2O43760 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR2O43760 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR2O43760 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR2O43760 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR2O43760 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYNGR2O43760 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYNGR2O43760 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYNGR2O43760 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYNGR2O43760 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms