Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
STX6O43752 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
STX6O43752 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
STX6O43752 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
STX6O43752 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
STX6O43752 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
STX6O43752 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
STX6O43752 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
STX6O43752 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STX6O43752 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
STX6O43752 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
STX6O43752 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STX6O43752 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STX6O43752 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STX6O43752 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STX6O43752 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
STX6O43752 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
STX6O43752 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
STX6O43752 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STX6O43752 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
STX6O43752 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
STX6O43752 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
STX6O43752 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
STX6O43752 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
STX6O43752 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
STX6O43752 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
STX6O43752 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
STX6O43752 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
STX6O43752 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
STX6O43752 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
STX6O43752 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
STX6O43752 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
STX6O43752 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
STX6O43752 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
STX6O43752 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STX6O43752 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STX6O43752 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STX6O43752 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
STX6O43752 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STX6O43752 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STX6O43752 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
STX6O43752 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STX6O43752 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
STX6O43752 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
STX6O43752 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
STX6O43752 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
STX6O43752 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
STX6O43752 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
STX6O43752 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
STX6O43752 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
STX6O43752 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
STX6O43752 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
STX6O43752 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
STX6O43752 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
STX6O43752 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
STX6O43752 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
STX6O43752 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
STX6O43752 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
STX6O43752 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
STX6O43752 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
STX6O43752 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
STX6O43752 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
STX6O43752 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
STX6O43752 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STX6O43752 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STX6O43752 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STX6O43752 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STX6O43752 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STX6O43752 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STX6O43752 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
STX6O43752 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
STX6O43752 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STX6O43752 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
STX6O43752 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
STX6O43752 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
STX6O43752 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
STX6O43752 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
STX6O43752 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STX6O43752 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STX6O43752 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STX6O43752 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
STX6O43752 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
STX6O43752 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
STX6O43752 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
STX6O43752 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
STX6O43752 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STX6O43752 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STX6O43752 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STX6O43752 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
STX6O43752 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STX6O43752 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
STX6O43752 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STX6O43752 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
STX6O43752 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
STX6O43752 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
STX6O43752 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STX6O43752 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
STX6O43752 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
STX6O43752 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
STX6O43752 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms