Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KCNQ3O43525 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KCNQ3O43525 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KCNQ3O43525 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KCNQ3O43525 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KCNQ3O43525 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KCNQ3O43525 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KCNQ3O43525 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
KCNQ3O43525 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
KCNQ3O43525 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
KCNQ3O43525 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
KCNQ3O43525 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
KCNQ3O43525 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
KCNQ3O43525 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
KCNQ3O43525 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KCNQ3O43525 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KCNQ3O43525 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KCNQ3O43525 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KCNQ3O43525 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KCNQ3O43525 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KCNQ3O43525 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KCNQ3O43525 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KCNQ3O43525 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KCNQ3O43525 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KCNQ3O43525 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KCNQ3O43525 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
KCNQ3O43525 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KCNQ3O43525 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KCNQ3O43525 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KCNQ3O43525 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KCNQ3O43525 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KCNQ3O43525 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
KCNQ3O43525 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KCNQ3O43525 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KCNQ3O43525 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KCNQ3O43525 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KCNQ3O43525 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KCNQ3O43525 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KCNQ3O43525 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
KCNQ3O43525 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KCNQ3O43525 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KCNQ3O43525 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KCNQ3O43525 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KCNQ3O43525 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
KCNQ3O43525 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KCNQ3O43525 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KCNQ3O43525 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KCNQ3O43525 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
KCNQ3O43525 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KCNQ3O43525 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KCNQ3O43525 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KCNQ3O43525 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KCNQ3O43525 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KCNQ3O43525 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KCNQ3O43525 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KCNQ3O43525 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KCNQ3O43525 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
KCNQ3O43525 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KCNQ3O43525 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KCNQ3O43525 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KCNQ3O43525 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KCNQ3O43525 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
KCNQ3O43525 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KCNQ3O43525 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
KCNQ3O43525 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KCNQ3O43525 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KCNQ3O43525 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KCNQ3O43525 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KCNQ3O43525 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KCNQ3O43525 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KCNQ3O43525 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KCNQ3O43525 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KCNQ3O43525 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KCNQ3O43525 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KCNQ3O43525 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KCNQ3O43525 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KCNQ3O43525 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KCNQ3O43525 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
KCNQ3O43525 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KCNQ3O43525 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KCNQ3O43525 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KCNQ3O43525 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
KCNQ3O43525 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KCNQ3O43525 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
KCNQ3O43525 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
KCNQ3O43525 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
KCNQ3O43525 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
KCNQ3O43525 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
KCNQ3O43525 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC32■■■□□ 2.71
KCNQ3O43525 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
KCNQ3O43525 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
KCNQ3O43525 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KCNQ3O43525 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KCNQ3O43525 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
KCNQ3O43525 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
KCNQ3O43525 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
KCNQ3O43525 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
KCNQ3O43525 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
KCNQ3O43525 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
KCNQ3O43525 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms