Protein–RNA interactions for Protein: O15247

CLIC2, Chloride intracellular channel protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC2O15247 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLIC2O15247 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLIC2O15247 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLIC2O15247 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIC2O15247 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIC2O15247 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIC2O15247 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIC2O15247 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIC2O15247 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIC2O15247 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIC2O15247 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIC2O15247 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIC2O15247 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIC2O15247 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIC2O15247 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIC2O15247 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIC2O15247 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIC2O15247 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIC2O15247 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIC2O15247 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIC2O15247 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIC2O15247 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIC2O15247 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIC2O15247 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIC2O15247 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIC2O15247 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIC2O15247 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIC2O15247 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIC2O15247 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLIC2O15247 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLIC2O15247 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLIC2O15247 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLIC2O15247 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLIC2O15247 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIC2O15247 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIC2O15247 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIC2O15247 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIC2O15247 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIC2O15247 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIC2O15247 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIC2O15247 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIC2O15247 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIC2O15247 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIC2O15247 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIC2O15247 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIC2O15247 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIC2O15247 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIC2O15247 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIC2O15247 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIC2O15247 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIC2O15247 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIC2O15247 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIC2O15247 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIC2O15247 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIC2O15247 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIC2O15247 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIC2O15247 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIC2O15247 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIC2O15247 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIC2O15247 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIC2O15247 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIC2O15247 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIC2O15247 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIC2O15247 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIC2O15247 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIC2O15247 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIC2O15247 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIC2O15247 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIC2O15247 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIC2O15247 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIC2O15247 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIC2O15247 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLIC2O15247 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLIC2O15247 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLIC2O15247 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIC2O15247 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIC2O15247 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIC2O15247 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIC2O15247 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIC2O15247 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIC2O15247 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIC2O15247 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIC2O15247 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIC2O15247 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIC2O15247 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIC2O15247 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIC2O15247 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIC2O15247 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIC2O15247 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIC2O15247 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIC2O15247 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIC2O15247 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIC2O15247 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIC2O15247 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIC2O15247 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIC2O15247 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIC2O15247 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIC2O15247 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIC2O15247 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIC2O15247 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms