Protein–RNA interactions for Protein: O15066

KIF3B, Kinesin-like protein KIF3B, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3BO15066 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
KIF3BO15066 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
KIF3BO15066 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
KIF3BO15066 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
KIF3BO15066 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
KIF3BO15066 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
KIF3BO15066 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
KIF3BO15066 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
KIF3BO15066 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
KIF3BO15066 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC37.17■■■■□ 3.54
KIF3BO15066 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
KIF3BO15066 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
KIF3BO15066 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
KIF3BO15066 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
KIF3BO15066 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
KIF3BO15066 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
KIF3BO15066 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
KIF3BO15066 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
KIF3BO15066 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
KIF3BO15066 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
KIF3BO15066 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
KIF3BO15066 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
KIF3BO15066 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
KIF3BO15066 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
KIF3BO15066 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
KIF3BO15066 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
KIF3BO15066 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
KIF3BO15066 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
KIF3BO15066 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
KIF3BO15066 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
KIF3BO15066 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
KIF3BO15066 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
KIF3BO15066 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
KIF3BO15066 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
KIF3BO15066 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
KIF3BO15066 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
KIF3BO15066 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
KIF3BO15066 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
KIF3BO15066 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
KIF3BO15066 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
KIF3BO15066 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
KIF3BO15066 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
KIF3BO15066 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
KIF3BO15066 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
KIF3BO15066 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
KIF3BO15066 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
KIF3BO15066 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
KIF3BO15066 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
KIF3BO15066 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
KIF3BO15066 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
KIF3BO15066 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
KIF3BO15066 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
KIF3BO15066 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
KIF3BO15066 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
KIF3BO15066 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
KIF3BO15066 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
KIF3BO15066 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
KIF3BO15066 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
KIF3BO15066 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
KIF3BO15066 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
KIF3BO15066 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
KIF3BO15066 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC37■■■■□ 3.51
KIF3BO15066 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
KIF3BO15066 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
KIF3BO15066 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
KIF3BO15066 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
KIF3BO15066 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
KIF3BO15066 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
KIF3BO15066 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
KIF3BO15066 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
KIF3BO15066 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
KIF3BO15066 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
KIF3BO15066 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
KIF3BO15066 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
KIF3BO15066 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
KIF3BO15066 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
KIF3BO15066 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
KIF3BO15066 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
KIF3BO15066 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
KIF3BO15066 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
KIF3BO15066 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
KIF3BO15066 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
KIF3BO15066 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
KIF3BO15066 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
KIF3BO15066 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
KIF3BO15066 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
KIF3BO15066 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
KIF3BO15066 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
KIF3BO15066 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
KIF3BO15066 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
KIF3BO15066 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
KIF3BO15066 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
KIF3BO15066 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
KIF3BO15066 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
KIF3BO15066 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
KIF3BO15066 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
KIF3BO15066 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
KIF3BO15066 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
KIF3BO15066 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
KIF3BO15066 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 333 ms