Protein–RNA interactions for Protein: O14910

LIN7A, Protein lin-7 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7AO14910 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIN7AO14910 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIN7AO14910 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIN7AO14910 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIN7AO14910 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIN7AO14910 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIN7AO14910 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIN7AO14910 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LIN7AO14910 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIN7AO14910 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIN7AO14910 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIN7AO14910 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIN7AO14910 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIN7AO14910 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIN7AO14910 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIN7AO14910 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIN7AO14910 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIN7AO14910 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIN7AO14910 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIN7AO14910 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LIN7AO14910 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LIN7AO14910 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIN7AO14910 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LIN7AO14910 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms