Protein–RNA interactions for Protein: O14657

TOR1B, Torsin-1B, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR1BO14657 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TOR1BO14657 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TOR1BO14657 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOR1BO14657 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOR1BO14657 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOR1BO14657 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOR1BO14657 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOR1BO14657 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOR1BO14657 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOR1BO14657 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOR1BO14657 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOR1BO14657 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOR1BO14657 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOR1BO14657 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOR1BO14657 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOR1BO14657 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOR1BO14657 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOR1BO14657 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOR1BO14657 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOR1BO14657 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOR1BO14657 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOR1BO14657 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOR1BO14657 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOR1BO14657 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOR1BO14657 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOR1BO14657 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOR1BO14657 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TOR1BO14657 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOR1BO14657 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TOR1BO14657 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOR1BO14657 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOR1BO14657 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOR1BO14657 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOR1BO14657 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOR1BO14657 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOR1BO14657 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOR1BO14657 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOR1BO14657 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOR1BO14657 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOR1BO14657 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOR1BO14657 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOR1BO14657 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOR1BO14657 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOR1BO14657 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TOR1BO14657 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOR1BO14657 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOR1BO14657 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOR1BO14657 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOR1BO14657 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TOR1BO14657 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOR1BO14657 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOR1BO14657 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TOR1BO14657 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TOR1BO14657 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOR1BO14657 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOR1BO14657 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOR1BO14657 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TOR1BO14657 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOR1BO14657 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOR1BO14657 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOR1BO14657 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOR1BO14657 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOR1BO14657 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms