Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAFD1O14545 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAFD1O14545 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAFD1O14545 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAFD1O14545 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAFD1O14545 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAFD1O14545 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAFD1O14545 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAFD1O14545 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAFD1O14545 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAFD1O14545 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAFD1O14545 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAFD1O14545 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAFD1O14545 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAFD1O14545 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAFD1O14545 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAFD1O14545 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAFD1O14545 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAFD1O14545 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAFD1O14545 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAFD1O14545 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAFD1O14545 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAFD1O14545 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAFD1O14545 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRAFD1O14545 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
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