Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM38O00635 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM38O00635 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM38O00635 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM38O00635 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM38O00635 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM38O00635 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM38O00635 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM38O00635 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM38O00635 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM38O00635 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM38O00635 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM38O00635 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM38O00635 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM38O00635 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM38O00635 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM38O00635 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM38O00635 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM38O00635 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM38O00635 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM38O00635 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM38O00635 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM38O00635 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM38O00635 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM38O00635 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM38O00635 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM38O00635 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM38O00635 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM38O00635 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM38O00635 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM38O00635 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM38O00635 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM38O00635 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM38O00635 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM38O00635 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM38O00635 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM38O00635 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM38O00635 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM38O00635 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM38O00635 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM38O00635 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms