Protein–RNA interactions for Protein: O00399

DCTN6, Dynactin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN6O00399 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCTN6O00399 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCTN6O00399 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCTN6O00399 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCTN6O00399 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN6O00399 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN6O00399 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN6O00399 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN6O00399 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN6O00399 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN6O00399 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN6O00399 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN6O00399 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN6O00399 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN6O00399 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN6O00399 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN6O00399 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN6O00399 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN6O00399 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCTN6O00399 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN6O00399 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN6O00399 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN6O00399 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN6O00399 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN6O00399 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCTN6O00399 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN6O00399 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN6O00399 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN6O00399 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN6O00399 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN6O00399 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN6O00399 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN6O00399 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCTN6O00399 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms