Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3B1O00203 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3B1O00203 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3B1O00203 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3B1O00203 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3B1O00203 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3B1O00203 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3B1O00203 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
AP3B1O00203 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP3B1O00203 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP3B1O00203 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP3B1O00203 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP3B1O00203 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP3B1O00203 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
AP3B1O00203 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP3B1O00203 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3B1O00203 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3B1O00203 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3B1O00203 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3B1O00203 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3B1O00203 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3B1O00203 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms