Protein–RNA interactions for Protein: H3BML4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BML4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BML4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BML4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BML4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BML4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BML4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BML4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BML4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BML4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BML4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BML4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BML4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BML4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BML4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BML4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BML4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BML4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BML4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BML4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BML4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BML4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BML4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BML4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BML4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BML4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BML4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BML4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BML4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BML4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BML4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BML4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BML4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BML4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BML4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BML4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BML4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BML4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BML4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BML4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BML4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BML4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BML4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BML4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BML4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BML4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BML4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BML4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BML4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BML4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BML4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BML4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BML4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BML4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BML4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BML4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BML4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BML4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BML4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BML4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BML4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BML4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BML4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BML4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BML4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BML4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BML4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BML4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BML4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BML4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BML4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BML4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BML4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BML4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BML4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BML4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BML4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BML4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BML4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BML4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BML4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BML4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BML4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BML4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BML4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BML4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BML4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BML4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BML4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BML4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BML4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BML4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BML4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BML4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BML4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BML4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BML4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BML4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BML4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BML4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BML4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms