Protein–RNA interactions for Protein: H3BM21

Integrin beta (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BM21 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BM21 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BM21 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BM21 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BM21 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BM21 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BM21 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BM21 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
H3BM21 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BM21 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BM21 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BM21 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BM21 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BM21 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BM21 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BM21 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BM21 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BM21 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BM21 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BM21 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BM21 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BM21 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BM21 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BM21 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BM21 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BM21 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BM21 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BM21 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BM21 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BM21 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BM21 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BM21 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BM21 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BM21 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BM21 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BM21 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BM21 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BM21 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BM21 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BM21 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
H3BM21 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
H3BM21 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BM21 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BM21 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BM21 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BM21 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BM21 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BM21 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BM21 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BM21 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BM21 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BM21 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
H3BM21 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H3BM21 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
H3BM21 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BM21 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BM21 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BM21 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BM21 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BM21 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BM21 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BM21 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BM21 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BM21 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BM21 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BM21 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BM21 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BM21 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BM21 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BM21 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BM21 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BM21 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BM21 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BM21 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BM21 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BM21 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BM21 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BM21 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BM21 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BM21 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BM21 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BM21 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BM21 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BM21 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BM21 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BM21 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BM21 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BM21 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BM21 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BM21 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BM21 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BM21 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BM21 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BM21 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BM21 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BM21 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BM21 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BM21 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H3BM21 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H3BM21 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms