Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PATL2C9JE40 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PATL2C9JE40 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PATL2C9JE40 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PATL2C9JE40 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PATL2C9JE40 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PATL2C9JE40 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PATL2C9JE40 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PATL2C9JE40 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PATL2C9JE40 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PATL2C9JE40 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PATL2C9JE40 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PATL2C9JE40 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PATL2C9JE40 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PATL2C9JE40 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PATL2C9JE40 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PATL2C9JE40 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PATL2C9JE40 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PATL2C9JE40 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PATL2C9JE40 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PATL2C9JE40 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PATL2C9JE40 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PATL2C9JE40 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PATL2C9JE40 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PATL2C9JE40 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PATL2C9JE40 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PATL2C9JE40 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PATL2C9JE40 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PATL2C9JE40 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PATL2C9JE40 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PATL2C9JE40 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PATL2C9JE40 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PATL2C9JE40 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PATL2C9JE40 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PATL2C9JE40 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PATL2C9JE40 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PATL2C9JE40 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PATL2C9JE40 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PATL2C9JE40 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PATL2C9JE40 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PATL2C9JE40 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PATL2C9JE40 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PATL2C9JE40 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PATL2C9JE40 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PATL2C9JE40 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PATL2C9JE40 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PATL2C9JE40 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PATL2C9JE40 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PATL2C9JE40 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PATL2C9JE40 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PATL2C9JE40 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PATL2C9JE40 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PATL2C9JE40 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PATL2C9JE40 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PATL2C9JE40 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PATL2C9JE40 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PATL2C9JE40 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PATL2C9JE40 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PATL2C9JE40 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PATL2C9JE40 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PATL2C9JE40 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PATL2C9JE40 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PATL2C9JE40 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PATL2C9JE40 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PATL2C9JE40 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PATL2C9JE40 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PATL2C9JE40 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PATL2C9JE40 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PATL2C9JE40 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PATL2C9JE40 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PATL2C9JE40 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PATL2C9JE40 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PATL2C9JE40 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PATL2C9JE40 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PATL2C9JE40 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PATL2C9JE40 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PATL2C9JE40 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PATL2C9JE40 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PATL2C9JE40 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PATL2C9JE40 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PATL2C9JE40 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PATL2C9JE40 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PATL2C9JE40 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PATL2C9JE40 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PATL2C9JE40 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PATL2C9JE40 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PATL2C9JE40 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PATL2C9JE40 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PATL2C9JE40 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PATL2C9JE40 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PATL2C9JE40 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PATL2C9JE40 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PATL2C9JE40 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PATL2C9JE40 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PATL2C9JE40 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PATL2C9JE40 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PATL2C9JE40 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PATL2C9JE40 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PATL2C9JE40 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
PATL2C9JE40 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms