Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPBD1B2RD01 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPBD1B2RD01 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPBD1B2RD01 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPBD1B2RD01 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPBD1B2RD01 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPBD1B2RD01 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPBD1B2RD01 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPBD1B2RD01 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBD1B2RD01 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBD1B2RD01 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBD1B2RD01 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPBD1B2RD01 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBD1B2RD01 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBD1B2RD01 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBD1B2RD01 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBD1B2RD01 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBD1B2RD01 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBD1B2RD01 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBD1B2RD01 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPBD1B2RD01 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPBD1B2RD01 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPBD1B2RD01 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPBD1B2RD01 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPBD1B2RD01 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPBD1B2RD01 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPBD1B2RD01 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPBD1B2RD01 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPBD1B2RD01 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPBD1B2RD01 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPBD1B2RD01 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPBD1B2RD01 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPBD1B2RD01 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPBD1B2RD01 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CENPBD1B2RD01 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPBD1B2RD01 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPBD1B2RD01 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPBD1B2RD01 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPBD1B2RD01 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPBD1B2RD01 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPBD1B2RD01 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPBD1B2RD01 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPBD1B2RD01 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPBD1B2RD01 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPBD1B2RD01 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPBD1B2RD01 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPBD1B2RD01 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPBD1B2RD01 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPBD1B2RD01 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBD1B2RD01 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBD1B2RD01 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBD1B2RD01 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPBD1B2RD01 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBD1B2RD01 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.4 ms