Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWV2

TRBV4-1, T-cell receptor beta variable 4-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRBV4-1A0A0J9YWV2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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