Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS05

TRBV5-7, T-cell receptor beta variable 5-7 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-7A0A0A0MS05 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRBV5-7A0A0A0MS05 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRBV5-7A0A0A0MS05 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRBV5-7A0A0A0MS05 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRBV5-7A0A0A0MS05 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRBV5-7A0A0A0MS05 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRBV5-7A0A0A0MS05 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRBV5-7A0A0A0MS05 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRBV5-7A0A0A0MS05 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV5-7A0A0A0MS05 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRBV5-7A0A0A0MS05 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV5-7A0A0A0MS05 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV5-7A0A0A0MS05 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV5-7A0A0A0MS05 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV5-7A0A0A0MS05 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV5-7A0A0A0MS05 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV5-7A0A0A0MS05 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV5-7A0A0A0MS05 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV5-7A0A0A0MS05 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV5-7A0A0A0MS05 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV5-7A0A0A0MS05 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV5-7A0A0A0MS05 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV5-7A0A0A0MS05 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV5-7A0A0A0MS05 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV5-7A0A0A0MS05 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRBV5-7A0A0A0MS05 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV5-7A0A0A0MS05 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRBV5-7A0A0A0MS05 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV5-7A0A0A0MS05 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV5-7A0A0A0MS05 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV5-7A0A0A0MS05 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV5-7A0A0A0MS05 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms