Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WXM4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WXM4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087WXM4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087WXM4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A087WXM4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A087WXM4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A087WXM4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A087WXM4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A087WXM4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087WXM4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087WXM4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087WXM4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087WXM4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087WXM4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A087WXM4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A087WXM4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A087WXM4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A087WXM4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A087WXM4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A087WXM4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A087WXM4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A087WXM4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A087WXM4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A087WXM4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A087WXM4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A087WXM4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A087WXM4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A087WXM4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087WXM4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087WXM4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087WXM4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087WXM4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms