Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G5

PCDHGA8, Protocadherin gamma-A8, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA8Q9Y5G5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHGA8Q9Y5G5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHGA8Q9Y5G5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHGA8Q9Y5G5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHGA8Q9Y5G5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHGA8Q9Y5G5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHGA8Q9Y5G5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHGA8Q9Y5G5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHGA8Q9Y5G5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHGA8Q9Y5G5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHGA8Q9Y5G5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHGA8Q9Y5G5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHGA8Q9Y5G5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHGA8Q9Y5G5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHGA8Q9Y5G5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHGA8Q9Y5G5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHGA8Q9Y5G5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHGA8Q9Y5G5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHGA8Q9Y5G5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHGA8Q9Y5G5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHGA8Q9Y5G5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHGA8Q9Y5G5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHGA8Q9Y5G5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHGA8Q9Y5G5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHGA8Q9Y5G5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHGA8Q9Y5G5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHGA8Q9Y5G5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PCDHGA8Q9Y5G5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHGA8Q9Y5G5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHGA8Q9Y5G5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHGA8Q9Y5G5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHGA8Q9Y5G5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHGA8Q9Y5G5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHGA8Q9Y5G5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHGA8Q9Y5G5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHGA8Q9Y5G5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHGA8Q9Y5G5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHGA8Q9Y5G5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHGA8Q9Y5G5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHGA8Q9Y5G5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHGA8Q9Y5G5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHGA8Q9Y5G5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHGA8Q9Y5G5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHGA8Q9Y5G5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHGA8Q9Y5G5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHGA8Q9Y5G5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHGA8Q9Y5G5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.8 ms