Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y597

KCTD3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3Q9Y597 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KCTD3Q9Y597 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KCTD3Q9Y597 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KCTD3Q9Y597 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCTD3Q9Y597 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCTD3Q9Y597 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCTD3Q9Y597 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCTD3Q9Y597 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCTD3Q9Y597 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KCTD3Q9Y597 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCTD3Q9Y597 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCTD3Q9Y597 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCTD3Q9Y597 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCTD3Q9Y597 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCTD3Q9Y597 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCTD3Q9Y597 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCTD3Q9Y597 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCTD3Q9Y597 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCTD3Q9Y597 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCTD3Q9Y597 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCTD3Q9Y597 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCTD3Q9Y597 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KCTD3Q9Y597 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCTD3Q9Y597 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCTD3Q9Y597 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCTD3Q9Y597 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCTD3Q9Y597 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCTD3Q9Y597 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCTD3Q9Y597 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCTD3Q9Y597 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCTD3Q9Y597 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCTD3Q9Y597 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCTD3Q9Y597 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCTD3Q9Y597 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCTD3Q9Y597 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCTD3Q9Y597 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCTD3Q9Y597 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCTD3Q9Y597 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCTD3Q9Y597 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCTD3Q9Y597 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCTD3Q9Y597 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCTD3Q9Y597 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KCTD3Q9Y597 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCTD3Q9Y597 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCTD3Q9Y597 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCTD3Q9Y597 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCTD3Q9Y597 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KCTD3Q9Y597 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCTD3Q9Y597 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCTD3Q9Y597 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCTD3Q9Y597 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCTD3Q9Y597 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCTD3Q9Y597 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCTD3Q9Y597 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCTD3Q9Y597 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCTD3Q9Y597 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCTD3Q9Y597 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCTD3Q9Y597 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCTD3Q9Y597 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCTD3Q9Y597 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms