Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UTP11Q9Y3A2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UTP11Q9Y3A2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UTP11Q9Y3A2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UTP11Q9Y3A2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UTP11Q9Y3A2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UTP11Q9Y3A2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UTP11Q9Y3A2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UTP11Q9Y3A2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
UTP11Q9Y3A2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UTP11Q9Y3A2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UTP11Q9Y3A2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UTP11Q9Y3A2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
UTP11Q9Y3A2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UTP11Q9Y3A2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UTP11Q9Y3A2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UTP11Q9Y3A2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UTP11Q9Y3A2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UTP11Q9Y3A2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UTP11Q9Y3A2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UTP11Q9Y3A2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UTP11Q9Y3A2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UTP11Q9Y3A2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UTP11Q9Y3A2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UTP11Q9Y3A2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
UTP11Q9Y3A2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UTP11Q9Y3A2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UTP11Q9Y3A2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UTP11Q9Y3A2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UTP11Q9Y3A2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UTP11Q9Y3A2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UTP11Q9Y3A2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UTP11Q9Y3A2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UTP11Q9Y3A2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UTP11Q9Y3A2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UTP11Q9Y3A2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UTP11Q9Y3A2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UTP11Q9Y3A2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UTP11Q9Y3A2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
UTP11Q9Y3A2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UTP11Q9Y3A2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UTP11Q9Y3A2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UTP11Q9Y3A2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UTP11Q9Y3A2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UTP11Q9Y3A2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UTP11Q9Y3A2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UTP11Q9Y3A2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UTP11Q9Y3A2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UTP11Q9Y3A2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UTP11Q9Y3A2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UTP11Q9Y3A2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UTP11Q9Y3A2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UTP11Q9Y3A2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UTP11Q9Y3A2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UTP11Q9Y3A2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UTP11Q9Y3A2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UTP11Q9Y3A2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UTP11Q9Y3A2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UTP11Q9Y3A2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UTP11Q9Y3A2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UTP11Q9Y3A2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UTP11Q9Y3A2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UTP11Q9Y3A2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UTP11Q9Y3A2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
UTP11Q9Y3A2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UTP11Q9Y3A2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UTP11Q9Y3A2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UTP11Q9Y3A2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UTP11Q9Y3A2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UTP11Q9Y3A2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UTP11Q9Y3A2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UTP11Q9Y3A2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UTP11Q9Y3A2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UTP11Q9Y3A2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UTP11Q9Y3A2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UTP11Q9Y3A2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UTP11Q9Y3A2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
UTP11Q9Y3A2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms