Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SIK3Q9Y2K2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIK3Q9Y2K2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIK3Q9Y2K2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIK3Q9Y2K2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIK3Q9Y2K2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIK3Q9Y2K2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIK3Q9Y2K2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIK3Q9Y2K2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIK3Q9Y2K2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIK3Q9Y2K2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIK3Q9Y2K2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIK3Q9Y2K2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIK3Q9Y2K2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIK3Q9Y2K2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SIK3Q9Y2K2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SIK3Q9Y2K2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SIK3Q9Y2K2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SIK3Q9Y2K2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIK3Q9Y2K2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIK3Q9Y2K2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIK3Q9Y2K2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIK3Q9Y2K2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIK3Q9Y2K2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIK3Q9Y2K2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIK3Q9Y2K2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIK3Q9Y2K2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIK3Q9Y2K2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIK3Q9Y2K2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220.3 ms