Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRPC6Q9Y210 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRPC6Q9Y210 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRPC6Q9Y210 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRPC6Q9Y210 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRPC6Q9Y210 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRPC6Q9Y210 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRPC6Q9Y210 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRPC6Q9Y210 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRPC6Q9Y210 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TRPC6Q9Y210 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRPC6Q9Y210 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRPC6Q9Y210 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRPC6Q9Y210 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TRPC6Q9Y210 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRPC6Q9Y210 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRPC6Q9Y210 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRPC6Q9Y210 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRPC6Q9Y210 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRPC6Q9Y210 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRPC6Q9Y210 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRPC6Q9Y210 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRPC6Q9Y210 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRPC6Q9Y210 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRPC6Q9Y210 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRPC6Q9Y210 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRPC6Q9Y210 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRPC6Q9Y210 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRPC6Q9Y210 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRPC6Q9Y210 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRPC6Q9Y210 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRPC6Q9Y210 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRPC6Q9Y210 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRPC6Q9Y210 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRPC6Q9Y210 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRPC6Q9Y210 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRPC6Q9Y210 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRPC6Q9Y210 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRPC6Q9Y210 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRPC6Q9Y210 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRPC6Q9Y210 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRPC6Q9Y210 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRPC6Q9Y210 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRPC6Q9Y210 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRPC6Q9Y210 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRPC6Q9Y210 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRPC6Q9Y210 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRPC6Q9Y210 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRPC6Q9Y210 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRPC6Q9Y210 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRPC6Q9Y210 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TRPC6Q9Y210 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRPC6Q9Y210 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRPC6Q9Y210 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRPC6Q9Y210 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRPC6Q9Y210 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRPC6Q9Y210 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRPC6Q9Y210 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRPC6Q9Y210 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRPC6Q9Y210 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRPC6Q9Y210 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRPC6Q9Y210 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TRPC6Q9Y210 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRPC6Q9Y210 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRPC6Q9Y210 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRPC6Q9Y210 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRPC6Q9Y210 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRPC6Q9Y210 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRPC6Q9Y210 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRPC6Q9Y210 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRPC6Q9Y210 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRPC6Q9Y210 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRPC6Q9Y210 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRPC6Q9Y210 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPC6Q9Y210 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPC6Q9Y210 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPC6Q9Y210 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPC6Q9Y210 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPC6Q9Y210 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPC6Q9Y210 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRPC6Q9Y210 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRPC6Q9Y210 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TRPC6Q9Y210 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRPC6Q9Y210 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRPC6Q9Y210 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRPC6Q9Y210 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TRPC6Q9Y210 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRPC6Q9Y210 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRPC6Q9Y210 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRPC6Q9Y210 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRPC6Q9Y210 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRPC6Q9Y210 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRPC6Q9Y210 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRPC6Q9Y210 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRPC6Q9Y210 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRPC6Q9Y210 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRPC6Q9Y210 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRPC6Q9Y210 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRPC6Q9Y210 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRPC6Q9Y210 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms