Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HHLA3Q9XRX5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HHLA3Q9XRX5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms