Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
HPS5Q9UPZ3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HPS5Q9UPZ3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HPS5Q9UPZ3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HPS5Q9UPZ3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HPS5Q9UPZ3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HPS5Q9UPZ3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HPS5Q9UPZ3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HPS5Q9UPZ3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HPS5Q9UPZ3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HPS5Q9UPZ3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HPS5Q9UPZ3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HPS5Q9UPZ3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HPS5Q9UPZ3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HPS5Q9UPZ3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HPS5Q9UPZ3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HPS5Q9UPZ3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HPS5Q9UPZ3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HPS5Q9UPZ3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HPS5Q9UPZ3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
HPS5Q9UPZ3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HPS5Q9UPZ3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HPS5Q9UPZ3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HPS5Q9UPZ3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HPS5Q9UPZ3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HPS5Q9UPZ3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HPS5Q9UPZ3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HPS5Q9UPZ3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HPS5Q9UPZ3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HPS5Q9UPZ3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HPS5Q9UPZ3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HPS5Q9UPZ3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HPS5Q9UPZ3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HPS5Q9UPZ3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HPS5Q9UPZ3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HPS5Q9UPZ3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HPS5Q9UPZ3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HPS5Q9UPZ3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HPS5Q9UPZ3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HPS5Q9UPZ3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HPS5Q9UPZ3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HPS5Q9UPZ3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HPS5Q9UPZ3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HPS5Q9UPZ3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
HPS5Q9UPZ3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HPS5Q9UPZ3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HPS5Q9UPZ3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HPS5Q9UPZ3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HPS5Q9UPZ3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HPS5Q9UPZ3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HPS5Q9UPZ3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HPS5Q9UPZ3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HPS5Q9UPZ3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HPS5Q9UPZ3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HPS5Q9UPZ3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HPS5Q9UPZ3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HPS5Q9UPZ3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HPS5Q9UPZ3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HPS5Q9UPZ3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HPS5Q9UPZ3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
HPS5Q9UPZ3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HPS5Q9UPZ3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HPS5Q9UPZ3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HPS5Q9UPZ3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
HPS5Q9UPZ3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
HPS5Q9UPZ3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms