Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ9

PCOLCE2, Procollagen C-endopeptidase enhancer 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE2Q9UKZ9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCOLCE2Q9UKZ9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCOLCE2Q9UKZ9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCOLCE2Q9UKZ9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCOLCE2Q9UKZ9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCOLCE2Q9UKZ9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCOLCE2Q9UKZ9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCOLCE2Q9UKZ9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCOLCE2Q9UKZ9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCOLCE2Q9UKZ9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCOLCE2Q9UKZ9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCOLCE2Q9UKZ9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCOLCE2Q9UKZ9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCOLCE2Q9UKZ9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCOLCE2Q9UKZ9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCOLCE2Q9UKZ9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCOLCE2Q9UKZ9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCOLCE2Q9UKZ9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCOLCE2Q9UKZ9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCOLCE2Q9UKZ9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCOLCE2Q9UKZ9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PCOLCE2Q9UKZ9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCOLCE2Q9UKZ9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCOLCE2Q9UKZ9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PCOLCE2Q9UKZ9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCOLCE2Q9UKZ9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCOLCE2Q9UKZ9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCOLCE2Q9UKZ9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCOLCE2Q9UKZ9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCOLCE2Q9UKZ9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCOLCE2Q9UKZ9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCOLCE2Q9UKZ9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCOLCE2Q9UKZ9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCOLCE2Q9UKZ9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCOLCE2Q9UKZ9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCOLCE2Q9UKZ9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCOLCE2Q9UKZ9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCOLCE2Q9UKZ9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PCOLCE2Q9UKZ9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCOLCE2Q9UKZ9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCOLCE2Q9UKZ9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PCOLCE2Q9UKZ9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCOLCE2Q9UKZ9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCOLCE2Q9UKZ9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCOLCE2Q9UKZ9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PCOLCE2Q9UKZ9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCOLCE2Q9UKZ9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCOLCE2Q9UKZ9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCOLCE2Q9UKZ9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCOLCE2Q9UKZ9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCOLCE2Q9UKZ9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCOLCE2Q9UKZ9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCOLCE2Q9UKZ9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCOLCE2Q9UKZ9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PCOLCE2Q9UKZ9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCOLCE2Q9UKZ9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCOLCE2Q9UKZ9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCOLCE2Q9UKZ9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCOLCE2Q9UKZ9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCOLCE2Q9UKZ9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCOLCE2Q9UKZ9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PCOLCE2Q9UKZ9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCOLCE2Q9UKZ9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCOLCE2Q9UKZ9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PCOLCE2Q9UKZ9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PCOLCE2Q9UKZ9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCOLCE2Q9UKZ9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCOLCE2Q9UKZ9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCOLCE2Q9UKZ9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCOLCE2Q9UKZ9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCOLCE2Q9UKZ9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCOLCE2Q9UKZ9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCOLCE2Q9UKZ9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCOLCE2Q9UKZ9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCOLCE2Q9UKZ9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCOLCE2Q9UKZ9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCOLCE2Q9UKZ9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCOLCE2Q9UKZ9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCOLCE2Q9UKZ9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCOLCE2Q9UKZ9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCOLCE2Q9UKZ9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCOLCE2Q9UKZ9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCOLCE2Q9UKZ9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCOLCE2Q9UKZ9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCOLCE2Q9UKZ9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PCOLCE2Q9UKZ9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCOLCE2Q9UKZ9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCOLCE2Q9UKZ9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCOLCE2Q9UKZ9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCOLCE2Q9UKZ9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCOLCE2Q9UKZ9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCOLCE2Q9UKZ9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCOLCE2Q9UKZ9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCOLCE2Q9UKZ9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCOLCE2Q9UKZ9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCOLCE2Q9UKZ9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCOLCE2Q9UKZ9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCOLCE2Q9UKZ9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.8 ms