Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHA6Q9UF33 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHA6Q9UF33 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHA6Q9UF33 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHA6Q9UF33 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHA6Q9UF33 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHA6Q9UF33 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHA6Q9UF33 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHA6Q9UF33 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHA6Q9UF33 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHA6Q9UF33 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHA6Q9UF33 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHA6Q9UF33 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHA6Q9UF33 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHA6Q9UF33 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHA6Q9UF33 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHA6Q9UF33 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHA6Q9UF33 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHA6Q9UF33 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHA6Q9UF33 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHA6Q9UF33 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHA6Q9UF33 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHA6Q9UF33 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHA6Q9UF33 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHA6Q9UF33 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHA6Q9UF33 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHA6Q9UF33 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHA6Q9UF33 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHA6Q9UF33 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHA6Q9UF33 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHA6Q9UF33 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHA6Q9UF33 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPHA6Q9UF33 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPHA6Q9UF33 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EPHA6Q9UF33 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPHA6Q9UF33 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHA6Q9UF33 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHA6Q9UF33 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHA6Q9UF33 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHA6Q9UF33 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHA6Q9UF33 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHA6Q9UF33 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHA6Q9UF33 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHA6Q9UF33 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHA6Q9UF33 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHA6Q9UF33 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHA6Q9UF33 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHA6Q9UF33 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHA6Q9UF33 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHA6Q9UF33 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHA6Q9UF33 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EPHA6Q9UF33 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EPHA6Q9UF33 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHA6Q9UF33 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHA6Q9UF33 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHA6Q9UF33 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHA6Q9UF33 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHA6Q9UF33 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHA6Q9UF33 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHA6Q9UF33 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHA6Q9UF33 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHA6Q9UF33 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHA6Q9UF33 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms