Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K3

RCOR3, REST corepressor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR3Q9P2K3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RCOR3Q9P2K3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RCOR3Q9P2K3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RCOR3Q9P2K3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RCOR3Q9P2K3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RCOR3Q9P2K3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RCOR3Q9P2K3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RCOR3Q9P2K3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RCOR3Q9P2K3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCOR3Q9P2K3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCOR3Q9P2K3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCOR3Q9P2K3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCOR3Q9P2K3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCOR3Q9P2K3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCOR3Q9P2K3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCOR3Q9P2K3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCOR3Q9P2K3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCOR3Q9P2K3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCOR3Q9P2K3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCOR3Q9P2K3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCOR3Q9P2K3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCOR3Q9P2K3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCOR3Q9P2K3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCOR3Q9P2K3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCOR3Q9P2K3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCOR3Q9P2K3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCOR3Q9P2K3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCOR3Q9P2K3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCOR3Q9P2K3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCOR3Q9P2K3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCOR3Q9P2K3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCOR3Q9P2K3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RCOR3Q9P2K3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCOR3Q9P2K3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCOR3Q9P2K3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCOR3Q9P2K3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCOR3Q9P2K3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RCOR3Q9P2K3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RCOR3Q9P2K3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCOR3Q9P2K3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCOR3Q9P2K3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCOR3Q9P2K3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCOR3Q9P2K3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RCOR3Q9P2K3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RCOR3Q9P2K3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RCOR3Q9P2K3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCOR3Q9P2K3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCOR3Q9P2K3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCOR3Q9P2K3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCOR3Q9P2K3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCOR3Q9P2K3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCOR3Q9P2K3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCOR3Q9P2K3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCOR3Q9P2K3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCOR3Q9P2K3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCOR3Q9P2K3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCOR3Q9P2K3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCOR3Q9P2K3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RCOR3Q9P2K3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RCOR3Q9P2K3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RCOR3Q9P2K3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RCOR3Q9P2K3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RCOR3Q9P2K3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RCOR3Q9P2K3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RCOR3Q9P2K3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RCOR3Q9P2K3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RCOR3Q9P2K3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCOR3Q9P2K3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCOR3Q9P2K3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCOR3Q9P2K3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCOR3Q9P2K3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCOR3Q9P2K3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCOR3Q9P2K3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RCOR3Q9P2K3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RCOR3Q9P2K3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RCOR3Q9P2K3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RCOR3Q9P2K3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RCOR3Q9P2K3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RCOR3Q9P2K3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RCOR3Q9P2K3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RCOR3Q9P2K3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RCOR3Q9P2K3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RCOR3Q9P2K3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RCOR3Q9P2K3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCOR3Q9P2K3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCOR3Q9P2K3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCOR3Q9P2K3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCOR3Q9P2K3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RCOR3Q9P2K3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCOR3Q9P2K3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCOR3Q9P2K3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCOR3Q9P2K3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCOR3Q9P2K3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCOR3Q9P2K3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCOR3Q9P2K3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCOR3Q9P2K3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCOR3Q9P2K3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCOR3Q9P2K3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RCOR3Q9P2K3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCOR3Q9P2K3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms