Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCHIP1Q9P0W5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCHIP1Q9P0W5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCHIP1Q9P0W5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCHIP1Q9P0W5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCHIP1Q9P0W5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCHIP1Q9P0W5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCHIP1Q9P0W5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCHIP1Q9P0W5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCHIP1Q9P0W5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCHIP1Q9P0W5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCHIP1Q9P0W5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCHIP1Q9P0W5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCHIP1Q9P0W5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCHIP1Q9P0W5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCHIP1Q9P0W5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCHIP1Q9P0W5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SCHIP1Q9P0W5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCHIP1Q9P0W5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCHIP1Q9P0W5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCHIP1Q9P0W5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCHIP1Q9P0W5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCHIP1Q9P0W5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCHIP1Q9P0W5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCHIP1Q9P0W5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCHIP1Q9P0W5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCHIP1Q9P0W5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCHIP1Q9P0W5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCHIP1Q9P0W5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCHIP1Q9P0W5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCHIP1Q9P0W5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCHIP1Q9P0W5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCHIP1Q9P0W5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms