Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0R6

GSKIP, GSK3B-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSKIPQ9P0R6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GSKIPQ9P0R6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GSKIPQ9P0R6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GSKIPQ9P0R6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GSKIPQ9P0R6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GSKIPQ9P0R6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GSKIPQ9P0R6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GSKIPQ9P0R6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GSKIPQ9P0R6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GSKIPQ9P0R6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GSKIPQ9P0R6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GSKIPQ9P0R6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GSKIPQ9P0R6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GSKIPQ9P0R6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GSKIPQ9P0R6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GSKIPQ9P0R6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GSKIPQ9P0R6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GSKIPQ9P0R6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GSKIPQ9P0R6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GSKIPQ9P0R6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GSKIPQ9P0R6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GSKIPQ9P0R6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GSKIPQ9P0R6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GSKIPQ9P0R6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GSKIPQ9P0R6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GSKIPQ9P0R6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GSKIPQ9P0R6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GSKIPQ9P0R6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GSKIPQ9P0R6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSKIPQ9P0R6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSKIPQ9P0R6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSKIPQ9P0R6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSKIPQ9P0R6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSKIPQ9P0R6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSKIPQ9P0R6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSKIPQ9P0R6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSKIPQ9P0R6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSKIPQ9P0R6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSKIPQ9P0R6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSKIPQ9P0R6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSKIPQ9P0R6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSKIPQ9P0R6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSKIPQ9P0R6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSKIPQ9P0R6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSKIPQ9P0R6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSKIPQ9P0R6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSKIPQ9P0R6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSKIPQ9P0R6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSKIPQ9P0R6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSKIPQ9P0R6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSKIPQ9P0R6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSKIPQ9P0R6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSKIPQ9P0R6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GSKIPQ9P0R6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GSKIPQ9P0R6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GSKIPQ9P0R6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GSKIPQ9P0R6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GSKIPQ9P0R6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSKIPQ9P0R6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms