Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN4

EHD2, EH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD2Q9NZN4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EHD2Q9NZN4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
EHD2Q9NZN4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EHD2Q9NZN4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EHD2Q9NZN4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EHD2Q9NZN4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EHD2Q9NZN4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EHD2Q9NZN4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EHD2Q9NZN4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EHD2Q9NZN4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EHD2Q9NZN4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
EHD2Q9NZN4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EHD2Q9NZN4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EHD2Q9NZN4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EHD2Q9NZN4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EHD2Q9NZN4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EHD2Q9NZN4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EHD2Q9NZN4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EHD2Q9NZN4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EHD2Q9NZN4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EHD2Q9NZN4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EHD2Q9NZN4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EHD2Q9NZN4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EHD2Q9NZN4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EHD2Q9NZN4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EHD2Q9NZN4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EHD2Q9NZN4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EHD2Q9NZN4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EHD2Q9NZN4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EHD2Q9NZN4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EHD2Q9NZN4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EHD2Q9NZN4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EHD2Q9NZN4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EHD2Q9NZN4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EHD2Q9NZN4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EHD2Q9NZN4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EHD2Q9NZN4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EHD2Q9NZN4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EHD2Q9NZN4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EHD2Q9NZN4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EHD2Q9NZN4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EHD2Q9NZN4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EHD2Q9NZN4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EHD2Q9NZN4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
EHD2Q9NZN4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EHD2Q9NZN4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EHD2Q9NZN4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EHD2Q9NZN4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EHD2Q9NZN4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EHD2Q9NZN4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EHD2Q9NZN4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EHD2Q9NZN4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EHD2Q9NZN4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EHD2Q9NZN4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EHD2Q9NZN4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EHD2Q9NZN4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EHD2Q9NZN4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EHD2Q9NZN4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EHD2Q9NZN4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
EHD2Q9NZN4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EHD2Q9NZN4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EHD2Q9NZN4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EHD2Q9NZN4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EHD2Q9NZN4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms