Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GDE1Q9NZC3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GDE1Q9NZC3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GDE1Q9NZC3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GDE1Q9NZC3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GDE1Q9NZC3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GDE1Q9NZC3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GDE1Q9NZC3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26■■□□□ 1.75
GDE1Q9NZC3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GDE1Q9NZC3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GDE1Q9NZC3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GDE1Q9NZC3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GDE1Q9NZC3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GDE1Q9NZC3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GDE1Q9NZC3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GDE1Q9NZC3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GDE1Q9NZC3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GDE1Q9NZC3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GDE1Q9NZC3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GDE1Q9NZC3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GDE1Q9NZC3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GDE1Q9NZC3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GDE1Q9NZC3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GDE1Q9NZC3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GDE1Q9NZC3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GDE1Q9NZC3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GDE1Q9NZC3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GDE1Q9NZC3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GDE1Q9NZC3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GDE1Q9NZC3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GDE1Q9NZC3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GDE1Q9NZC3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GDE1Q9NZC3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GDE1Q9NZC3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GDE1Q9NZC3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GDE1Q9NZC3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GDE1Q9NZC3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GDE1Q9NZC3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GDE1Q9NZC3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GDE1Q9NZC3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GDE1Q9NZC3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GDE1Q9NZC3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GDE1Q9NZC3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GDE1Q9NZC3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GDE1Q9NZC3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GDE1Q9NZC3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GDE1Q9NZC3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GDE1Q9NZC3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GDE1Q9NZC3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDE1Q9NZC3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDE1Q9NZC3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDE1Q9NZC3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GDE1Q9NZC3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GDE1Q9NZC3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GDE1Q9NZC3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GDE1Q9NZC3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GDE1Q9NZC3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GDE1Q9NZC3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GDE1Q9NZC3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GDE1Q9NZC3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GDE1Q9NZC3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GDE1Q9NZC3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GDE1Q9NZC3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GDE1Q9NZC3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GDE1Q9NZC3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GDE1Q9NZC3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GDE1Q9NZC3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDE1Q9NZC3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDE1Q9NZC3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDE1Q9NZC3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDE1Q9NZC3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDE1Q9NZC3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GDE1Q9NZC3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GDE1Q9NZC3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDE1Q9NZC3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GDE1Q9NZC3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GDE1Q9NZC3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GDE1Q9NZC3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GDE1Q9NZC3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GDE1Q9NZC3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GDE1Q9NZC3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GDE1Q9NZC3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
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