Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
COA4Q9NYJ1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COA4Q9NYJ1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COA4Q9NYJ1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COA4Q9NYJ1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COA4Q9NYJ1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COA4Q9NYJ1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
COA4Q9NYJ1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COA4Q9NYJ1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COA4Q9NYJ1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COA4Q9NYJ1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
COA4Q9NYJ1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COA4Q9NYJ1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COA4Q9NYJ1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COA4Q9NYJ1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COA4Q9NYJ1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COA4Q9NYJ1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COA4Q9NYJ1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COA4Q9NYJ1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms