Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXK8

FBXL12, F-box/LRR-repeat protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL12Q9NXK8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXL12Q9NXK8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXL12Q9NXK8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXL12Q9NXK8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXL12Q9NXK8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXL12Q9NXK8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
FBXL12Q9NXK8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXL12Q9NXK8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXL12Q9NXK8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXL12Q9NXK8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXL12Q9NXK8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXL12Q9NXK8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXL12Q9NXK8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXL12Q9NXK8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXL12Q9NXK8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXL12Q9NXK8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXL12Q9NXK8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXL12Q9NXK8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXL12Q9NXK8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXL12Q9NXK8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXL12Q9NXK8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXL12Q9NXK8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXL12Q9NXK8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXL12Q9NXK8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXL12Q9NXK8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXL12Q9NXK8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FBXL12Q9NXK8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXL12Q9NXK8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXL12Q9NXK8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXL12Q9NXK8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXL12Q9NXK8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXL12Q9NXK8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms