Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SARS2Q9NP81 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SARS2Q9NP81 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SARS2Q9NP81 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SARS2Q9NP81 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SARS2Q9NP81 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SARS2Q9NP81 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SARS2Q9NP81 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SARS2Q9NP81 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SARS2Q9NP81 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SARS2Q9NP81 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SARS2Q9NP81 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SARS2Q9NP81 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SARS2Q9NP81 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SARS2Q9NP81 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SARS2Q9NP81 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SARS2Q9NP81 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SARS2Q9NP81 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SARS2Q9NP81 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SARS2Q9NP81 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SARS2Q9NP81 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SARS2Q9NP81 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SARS2Q9NP81 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SARS2Q9NP81 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SARS2Q9NP81 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SARS2Q9NP81 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SARS2Q9NP81 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SARS2Q9NP81 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SARS2Q9NP81 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SARS2Q9NP81 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SARS2Q9NP81 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SARS2Q9NP81 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SARS2Q9NP81 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SARS2Q9NP81 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SARS2Q9NP81 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SARS2Q9NP81 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SARS2Q9NP81 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SARS2Q9NP81 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SARS2Q9NP81 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SARS2Q9NP81 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SARS2Q9NP81 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SARS2Q9NP81 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SARS2Q9NP81 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SARS2Q9NP81 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SARS2Q9NP81 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SARS2Q9NP81 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SARS2Q9NP81 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SARS2Q9NP81 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SARS2Q9NP81 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SARS2Q9NP81 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SARS2Q9NP81 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SARS2Q9NP81 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SARS2Q9NP81 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SARS2Q9NP81 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SARS2Q9NP81 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SARS2Q9NP81 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SARS2Q9NP81 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SARS2Q9NP81 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SARS2Q9NP81 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SARS2Q9NP81 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SARS2Q9NP81 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SARS2Q9NP81 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SARS2Q9NP81 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SARS2Q9NP81 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SARS2Q9NP81 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SARS2Q9NP81 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SARS2Q9NP81 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SARS2Q9NP81 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SARS2Q9NP81 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SARS2Q9NP81 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SARS2Q9NP81 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SARS2Q9NP81 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SARS2Q9NP81 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SARS2Q9NP81 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SARS2Q9NP81 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SARS2Q9NP81 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SARS2Q9NP81 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SARS2Q9NP81 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SARS2Q9NP81 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SARS2Q9NP81 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SARS2Q9NP81 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SARS2Q9NP81 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SARS2Q9NP81 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SARS2Q9NP81 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SARS2Q9NP81 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SARS2Q9NP81 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SARS2Q9NP81 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SARS2Q9NP81 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SARS2Q9NP81 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SARS2Q9NP81 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SARS2Q9NP81 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SARS2Q9NP81 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SARS2Q9NP81 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms