Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRPV4Q9HBA0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRPV4Q9HBA0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRPV4Q9HBA0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRPV4Q9HBA0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRPV4Q9HBA0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRPV4Q9HBA0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRPV4Q9HBA0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRPV4Q9HBA0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRPV4Q9HBA0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRPV4Q9HBA0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRPV4Q9HBA0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRPV4Q9HBA0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRPV4Q9HBA0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRPV4Q9HBA0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRPV4Q9HBA0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRPV4Q9HBA0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRPV4Q9HBA0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRPV4Q9HBA0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRPV4Q9HBA0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRPV4Q9HBA0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRPV4Q9HBA0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRPV4Q9HBA0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRPV4Q9HBA0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRPV4Q9HBA0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRPV4Q9HBA0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRPV4Q9HBA0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRPV4Q9HBA0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRPV4Q9HBA0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRPV4Q9HBA0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRPV4Q9HBA0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRPV4Q9HBA0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRPV4Q9HBA0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRPV4Q9HBA0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRPV4Q9HBA0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRPV4Q9HBA0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRPV4Q9HBA0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRPV4Q9HBA0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRPV4Q9HBA0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRPV4Q9HBA0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRPV4Q9HBA0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRPV4Q9HBA0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRPV4Q9HBA0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRPV4Q9HBA0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRPV4Q9HBA0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRPV4Q9HBA0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRPV4Q9HBA0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TRPV4Q9HBA0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRPV4Q9HBA0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRPV4Q9HBA0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRPV4Q9HBA0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRPV4Q9HBA0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRPV4Q9HBA0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRPV4Q9HBA0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRPV4Q9HBA0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRPV4Q9HBA0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRPV4Q9HBA0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRPV4Q9HBA0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRPV4Q9HBA0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRPV4Q9HBA0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRPV4Q9HBA0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRPV4Q9HBA0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRPV4Q9HBA0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRPV4Q9HBA0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRPV4Q9HBA0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRPV4Q9HBA0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRPV4Q9HBA0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRPV4Q9HBA0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRPV4Q9HBA0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRPV4Q9HBA0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRPV4Q9HBA0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRPV4Q9HBA0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRPV4Q9HBA0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRPV4Q9HBA0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRPV4Q9HBA0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPV4Q9HBA0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPV4Q9HBA0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPV4Q9HBA0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPV4Q9HBA0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPV4Q9HBA0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPV4Q9HBA0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPV4Q9HBA0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPV4Q9HBA0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPV4Q9HBA0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPV4Q9HBA0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPV4Q9HBA0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPV4Q9HBA0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPV4Q9HBA0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPV4Q9HBA0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPV4Q9HBA0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPV4Q9HBA0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPV4Q9HBA0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPV4Q9HBA0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPV4Q9HBA0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPV4Q9HBA0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPV4Q9HBA0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPV4Q9HBA0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPV4Q9HBA0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPV4Q9HBA0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPV4Q9HBA0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms